xGen Pan-Cancer Panel

xGen Pan-Cancer Panel是一个基于癌症基因组图谱(TCGA)网络的研究发现而设计的杂交捕获panel。TCGA网络对12种癌症类型的3000多个肿瘤病例进行了系统分析,以研究癌症起始和进展的潜在机制,并在这些肿瘤类型中鉴定出127个显著突变基因(SMGs)。
 xGen Pan-Cancer Panel v1.5由7816个xGen Lockdown探针组成,含括800kb的人类基因组,用于富集捕获涉及12种肿瘤组织类型的127个显著突变基因,从而实现更深层次的靶向测序覆盖度。
panel组成(靶基因)
1. 12种癌症中显著突变的基因。12种癌症中发现127个基因发生显著突变,这些基因通过基因通路组织起来。图中显示了每种癌症类型的样本中含有突变基因的百分比,每种癌症的最高百分比以粗体显示。[资料来源:kanade等人(2013)《Nature》502:333-339]