QuantSeq-Flex 靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2



QuantSeq-Flex RNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行第一链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。

 


产品优势
试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;
>100多重引物的靶向文库构建;
每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;
识别已知和未知融合转录本;
只需4.5小时即可完成RNA文库构建;
节省测序成本,Dual index兼容多达9,216种组合(i5 / i7组合)。

 


工作流程
使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:
1) Oligo(dT)用于第一链合成,随机引物用于第二链合成(Quantseq FWD);
2) Oligo(dT)用第一链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’ mRNA-Seq);
3) 特异性靶向引物用于第一链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);
4) 特异性靶向引物用于第一链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。


Fig.2所示,靶向引物构建的文库。针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf (BRAF, NM_004333.4)、受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2 (ERBB2, NM_001005862.2)和KRAS原癌基因GTPase (KRAS, NM_004985.4)设计了引物,以K562细胞的总RNA为模板,用QuantSeq-Flex试剂盒进行建库。Fig.3展示以不同RNA起始量(500ng, 100ng和10ng)检测BCR-ABL基因的融合转录本。


Figure 2 | 靶向引物构建的文库。针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf (BRAF,NM_004333.4),受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2 (ERBB2, NM_001005862.2)和KRAS原癌基因,GTPase (KRAS, NM_004985.4)设计了引物,以K562细胞的总RNA为模板用QuantSeq-Flex试剂盒进行建库。

Figure 3 | BCR-ABL融合基因靶向文库的片段分析。

Figure 1 | QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq建库试剂盒V2工作流程图。反转录反应可以使用oligo(dT)引物(包含在试剂盒中),也可以使用目标特异性引物(不包含,为靶向定制)。第二链合成可以使用随机引物(包含在试剂盒中)或使用目标特异性引物(不包含,为靶向定制)。对于随机引物启动第二链合成,则需要进行RNA去除骤,当使用目标特异性引物合成第二链时,RNA去除步骤可省略。根据使用引物的类型,可生成四种不同的文库。


说明书附件下载:

NOTE for QS Flex_customers_A5_2 pages
QuantSeq-Flex - Product Flyer              
QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒说明书-简易版
QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒说明书-详细版- Illumina

 

QuantSeq-Flex 靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2

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