AMPure XP核酸纯化试剂盒

AMPure XP 核酸纯化试剂盒适用于不同基因组应用中的 DNA 纯化步骤,如二代测序(NGS)、qPCR/ddPCR/PCR、基因芯片及其他酶反应。 基于 SPRI 技术 (固相载体可逆固定化)的AMPure XP,采用超顺磁性磁珠按类型和大小选择性地与核酸结合。

AMPure XP 试剂可最大限度地提高回收率、重复性和回收速度,从而加速整个 NGS 工作流进程,满足当今严苛的基因组应用需求,最大限度避免遗漏重要的遗传信息。鉴于此,超 200 款文库构建试剂盒推荐使用 AMPure XP作为唯一的纯化选项,包括来自业内主流测序公司(如Illumina,Oxford Nanopore Technologies、PacBio和Thermo Scientific)的试剂盒。

AMPure XP核酸纯化试剂盒既可采用手动操作 也可搭配自动化工作站实现自动化操作, 具体取决于批次运行数目或实验整体通量。

在表1中,您可查看分别运行48个、96个和 4 x 96个样品 AMPure XP 纯化所预估的手工时间和自动化时间(以分钟计)。

 

 

 

 

手动工作流程

自动化工作流程

运行批次大小

8

手工处理时间

10

10

总时间

20

40

24

手工处理时间

15

10

总时间

25

42

48

手工处理时间

NR

15

总时间

NR

51

96

手工处理时间

NR

15

总时间

NR

60

NR=不推荐

1 AMPure XP纯化手动工作流程和自动化工作流程所需时间对比

 

产品特点

 

 结合DNA片段

 高回收率,高效回收大于100 bp的扩增片段

 有效去除多余的 dNTP、引物、引物二聚体、盐离子和其他杂质

 尺寸选择一致可预测

 

 

SPRI 磁珠技术

 

作为一种先进的核酸提取方法,SPRI 磁珠技术采用固相可逆固定化技术,利用顺磁珠按类型和大小选择性与核酸结合。该技术于20世纪90年代由MIT’s Whitehead Institute(麻省理工学院怀特海德研究所)开发,在人类基因组计划中,特别是在Sanger测序方案的PCR产物纯化应用中发挥了至关重要的作用。

SPRI技术应用于基因组试剂中,可提取高质量核酸样品,并在基因组研究中提供可靠和准确的结果。提取产物可支持各种下游应用,如qPCR、ddPCR、Sanger测序、下一代测序(NGS)和微阵列分析。

SPRI磁珠的大小为1μm±8%,由三层结构构成。核心部分由聚苯乙烯(Polystyrene,PS)浮力材料制成,第二层包裹一层薄薄的磁性材料,使磁珠产生超顺磁性,且易于通过磁场操控。外表面覆盖羧基修饰层,为DNA片段的结合提供电荷基团。

作为SPRI试剂不可或缺的组成部分,SPRI磁珠为核酸结合提供了固定支撑物 。我们基因组试剂的两大主要特性有助于SPRI磁珠充分发挥其功能:

 拥挤剂 迫使特定大小的核酸脱离表面,形成水合溶液相。

 结合缓冲液 提供盐离子并调节pH值,促进核酸与磁珠结合。

1 SPRI 磁珠的结构

 

 

 

工作流程

 

AMPure XP 工作流程:

 将磁珠与DNA结合

 将结合有核酸的磁珠与杂质分离

  70% 乙醇洗涤磁珠以去除杂质

 从磁珠上洗脱DNA

 转移至新板

 

2 AMPure XP工作流程示意图

 

 

规格参数

 

起始核酸

PCR产物、片段化DNA

起始核酸

DNA

回收

AMPure XP试剂主要结合并纯化> 100 bp的PCR产物。标准回收率在60-90%之间,通常在70-90%之间。

磁珠ratio值

1.8 倍用于纯化。

规格

液体

体积

5 毫升、60 毫升或 450 毫升

应用领域

PCR和DNA产物纯化、NGS文库纯化

处理模式

自动或手动

技术

基于SPRI的超顺磁性磁珠技术

存储温度

4 °C

 

 

产品数据

 

下图展示了使用 AMPure XP 试剂纯化剪切 gDNA 并采用Agilent TapeStation system分析结果,数据表明:参比值与 1.8X ratio值之间的相对差异印证了AMPure XP 试剂在保持高效回收率的同时,确保可预测的高性能。

 

 

避免丢失关键数据

当您在研究中投入了大量资金时,AMPure XP 试剂是您纯化和提取步骤的不二之选。在这一关键步骤中,产量损失会导致关键数据丢失,从而可能错失最重要的研究发现。与其他核酸纯化试剂相比,AMPure XP试剂可帮助用户多保留多达 34% 的遗传信息。

 

 

 

*该信息图显示了核酸提取、文库构建、文库富集、纯化和测序等NGS应用步骤所对应的成本。该成本基于2017年市售试剂盒及其平均标价进行计算。完成已知量DNA纯化步骤后,采用Picogreen Assay测定DNA总产量以计算纯化效率。然后使用相对于AMPure XP试剂性能的得率,来计算效率对各种市售文库构建方法和纯化试剂更改的影响。

 

订购信息

 

产品名称

货号

规格

AMPure XP Reagent, 5 mL

A63880

5 mL

AMPure XP Reagent, 60 mL

A63881

60 mL

AMPure XP Reagent, 450 mL

A63882

450 mL